Canónigos regulares
 

La actual parroquia de Sant Pere dels Arquells era una canónica filial de la de Santa Maria de l'Estany. En 1084 consta la existencia de una iglesia que estuvo dotada económicamente, quizás con la intención de fundar un monasterio. Más adelante, en 1100 el lugar fue donado al Estany para que instaurara un priorato. En el transcurso de los siglos XII al XIV el lugar tuvo una vida relativamente sólida, pero al caer en decadencia la casa del Estany, ésta también perdió vitalidad.

Se secularizó en 1592 y pasó a manos de Santa Maria de Montserrat, como priorato, hasta 1835. Durante los siglos XVII y XVIII pasó a ser más bien una granja regida por un prior de Montserrat. Actualmente es una parroquia.