Aquest monestir actualment pràcticament ha desaparegut. Es tracta d’una antiga fundació depenent de San Pedro de Arlanza i que, segons les restes arqueològiques trobades, tindria un origen visigòtic. Covarrubias es trobava dintre de la seva jurisdicció, fins l’any 973. Tampoc va perdurar molt en el temps, hom té constància que a finals del segle XI ja era en ruïnes.

La seva importància li ve donada pel seu escriptori, del que hom té constància de diverses obres entre les quals destaca la bíblia que actualment es conserva a la biblioteca de San Isidoro de León datada en l’any 960 i signada pel copista Sancho i l’il·luminador Florencio.