La fundación del monasterio de Carrizo se llevó a cabo en 1176 gracias a la intervención de Estefanía Ramírez, entonces viuda del conde Pedro Ponce de Minerva, los mismos que unos años antes habían fundado el monasterio de Santa María de Sandoval. Con este fin entregó varias posesiones al Císter, entre ellas el lugar de Carrizo, donde debía levantarse el nuevo monasterio. El noble Ponce de Minerva probablemente era originario del Languedoc y se convirtió en un personaje de peso en la corte y gracias a ello pudo acumular un importante patrimonio, lo que permitió las fundaciones mencionadas.

La construcción del monasterio comenzó antes del acto fundacional, probablemente aún en vida del conde. Una vez fundado, la misma condesa ​​ingresó en él y vivió en este lugar hasta su muerte (1183), la primera abadesa fue María, hija de los fundadores. Gracias a la protección de la casa real, el monasterio de Carrizo se convirtió en un centro religioso de importancia, al tiempo que ejercía el señorío sobre un amplio territorio. Prácticamente siempre mantuvo su prosperidad, sólo interrumpida temporalmente por los asuntos políticos del siglo XIX cuando la comunidad fue exclaustrada entre los años 1867 y 1871, refugiándose en el cercano monasterio premostratense de Villoria, un mal menor si lo comparamos con los graves efectos que sufrieron otras comunidades.

El monasterio conserva aún un valioso patrimonio, tanto arquitectónico, con una iglesia de la época fundacional, aunque ampliada, y la sala capitular. También conserva buena parte de su archivo y mobiliario, aunque algunas piezas importantes se encuentran actualmente fuera del establecimiento monástico. El monasterio sigue todavía su actividad con una comunidad de monjas cistercienses de la Trapa.