Tradicionalmente se considera que la fundación de esta casa fue inspirada por el mismo san Francisco en su visita a la ciudad y al sepulcro del apóstol. Según esto, su fundador fue Cotolay, a quien el santo se dirigió para encargarle la empresa fundacional, con su intervención milagrosa para financiar la obra. El primer convento se levantó en el siglo XIII pero cayó en ruina en 1700 y se reconstruyó de nuevo entre los años 1742 y 1770.