Pouilly fut l’un des prieurés établis dans la région du Forez. Plusieurs donations de biens situés à Pouilly furent consenties en faveur de l’abbaye de Cluny (Saône-et-Loire) durant la seconde moitié du XIe siècle, la première étant datée de 966. Le prieuré aurait été fondé ici par Cluny vers la fin de ce même siècle. Plus tard, en 1239, le comte Guigues IV le favorisa dans son testament.
Ce fut un prieuré modeste, à vocation agricole, particulièrement réputé pour sa production de vin. L’ancienne église du lieu était dédiée à Saint-Didier, tandis que les moines bâtirent l’église priorale entre les XIe et XIIe siècles. La première pierre fut posée en 1048 et l’église dédiée à Saint-Pierre. Dès le XIIIe siècle, le prieuré présentait de graves problèmes de conservation et, au XIVe siècle, il fut reconstruit, en même temps que la ville était fortifiée. Des travaux d’amélioration se poursuivirent ensuite. Les moines quittèrent le prieuré en 1715 et y laissèrent un administrateur chargé de gérer ses affaires. Après la Révolution, il fut vendu. Aujourd’hui, on conserve l’église d’origine romane ainsi que le bâtiment prioral, très transformés et remaniés au fil du temps.
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