Il s’agit d’un prieuré bénédictin fondé par l’évêque Étienne II de Clermont (942-984), probablement sur l’emplacement d’un ancien monastère féminin qui serait resté abandonné durant de longues années à la suite d’une invasion normande. Lors de sa fondation, ou plutôt de sa refondation, le prieuré fut placé sous l’autorité de la grande abbaye de Saint-Pierre de Mozac (Puy-de-Dôme).
Le prieuré fut dédié à saint Léger d’Autun († 678), contemporain de l’évêque saint Priest de Clermont († 676), que la tradition associe au premier établissement monastique de Royat. En 1095, lorsque Mozac fut rattachée à l’abbaye de Cluny avec le soutien des comtes d’Auvergne, le prieuré de Royat suivit le même chemin. En 1169, le roi de France Louis VII le Jeune (1120-1180) l’inclut dans un acte de confirmation des biens de Mozac. Le site fut fortifié aux XIIIe et XIVe siècles, et les bâtiments conventuels furent modifiés au XVIe siècle.
À Royat subsiste une église à nef unique de deux travées, précédée d’un narthex. Elle comprend également un transept, un unique chevet de plan rectangulaire, ainsi qu’une crypte. L’édifice, construit à l’époque fondatrice, a été profondément modifié au fil du temps : dès le XIIe siècle, puis lors de sa fortification et enfin au XIXe siècle, lors de la restauration qui entraîna la perte de l’ancien clocher. On conserve également les bâtiments conventuels au nord de l’église.
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