La actual iglesia de Sant Feliu es una obra gótica, un edificio que se levantó durante el siglo XIV sobre otras construcciones de época anterior. Más adelante se hicieron otras modificaciones, como la fachada de poniente y la capilla de San Narciso, del siglo XVII y de grandes dimensiones.

Sant Feliu de Girona conserva aún un valioso mobiliario en la misma iglesia, además del que se guarda en el Museu d'Art de Girona.

En el presbiterio de Sant Feliu se encuentra un valioso conjunto de ocho sarcófagos empotrados en los muros y que tradicionalmente se considera que fueron recogidos en el mismo lugar de la iglesia, donde se situaría una antigua necrópolis. En una capilla lateral también se conserva un sarcófago con dos ángeles sosteniendo un sol, que lleva una inscripción fechada en 1214 y que antes se encontraba en el exterior, junto a la portada sur.

En el Museu d'Art de Girona se conserva una arqueta con placas de marfil, posiblemente de origen siciliano y que pertenecía a la canónica de Sant Feliu. También de la misma procedencia y situación actual es el Homiliario de Beda, un valioso manuscrito iluminado el origen del cual es desconocido y en cuanto a su datación, esta ha generado diversas teorías.

Entre los años 1504 y 1520 se construyó un gran retablo, que presidió el presbiterio hasta que fue desmontado en 1936 y que ahora se conserva dividido, una buena parte en el Museu d'Art de Girona y otros elementos remontados en un mueble de dimensiones más modestas aún conservado en Sant Feliu. En su elaboración participaron diversos artistas: Joan Venetrica, Pere Robredo y Joan de Aragón fueron los autores de las esculturas. Las tablas pintadas más pequeñas del sotabancal son obra de Perris Fontaines. Juan de Borgunya fue el autor de las seis tablas grandes con escenas de la vida y martirio de san Feliu, que realizó entre los años 1518 y 1520.

Aloi de Montbrai contrató un grupo con un Santo entierro del que destaca la figura de Cristo muerto, obra situada a mediados del siglo XIV y que se considera que elaboró Jaume Cascalls, socio del anterior.

Juan de Tournai ejecutó entre el 1326 y 1328 el Sepulcro de San Narciso, que se conserva todavía la iglesia. Está formado por la imagen yacente del santo sobre la tapa del sepulcro, y de una serie de escenas de su vida en el frontal. Esta pieza tenía un apertura en la parte posterior por donde se podía ver el cuerpo del santo y que se cubría con una tapa de madera policromada, que aún se conserva en el Museu d'Art de Girona.